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임상 라이브러리 시각화 조회 권한 요청

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  • 임상 라이브러리

임상 라이브러리란?

  • 참여기관에 구축되어 있는 전자의무기록 및 임상데이터베이스로부터 기본적 임상데이터(BaseLine DB)와 질환별* 임상데이터를
    표준화된 규격으로 수집하여 다기관 연구 목적으로 구축한 임상 데이터셋※ 암(‘22 ~ ‘25년도), 호흡기, 심혈관

원내임상 라이브러리 시스템 구성도

Baseline DB
                      	OMOP CDM 구조 DB
                      	
                      	추출
                      	
                      	메타 데이터 / 메타 통계 데이터
                      	
                      	3대 질환특화
                      	암 임상 라이브러리 (‘22년 ~ ‘25년)
                      	
                      	연계
                      	
                      	‘22년
                      	유방암 / 위암
                      	
                      	‘23년
                      	간암 / 대장암
                      	
                      	‘24년
                      	췌장암 / 폐암 / 전립선암
                      	
                      	‘25년
                      	자궁경부암 / 신장암 / 혈액암
                      	
                      	호흡기질환 임상 라이브러리 (추진예정)
                      	
                      	심혈관질환 임상 라이브러리 (추진예정)
                      	
                      	추출 Baseline DB
                      	OMOP CDM 구조 DB
                      	
                      	추출
                      	
                      	메타 데이터 / 메타 통계 데이터
                      	
                      	3대 질환특화
                      	암 임상 라이브러리 (‘22년 ~ ‘25년)
                      	
                      	연계
                      	
                      	‘22년
                      	유방암 / 위암
                      	
                      	‘23년
                      	간암 / 대장암
                      	
                      	‘24년
                      	췌장암 / 폐암 / 전립선암
                      	
                      	‘25년
                      	자궁경부암 / 신장암 / 혈액암
                      	
                      	호흡기질환 임상 라이브러리 (추진예정)
                      	
                      	심혈관질환 임상 라이브러리 (추진예정)
                      	
                      	추출

1. Baseline DB

  • (정의) 특정 질환에 관계없이 기본적 임상 데이터를 참여기관들의 공통 기준에 맞추어 CDW 형태로 구축한 데이터 베이스
  • (모델) 6개 그룹, 39개 테이블로 구성되며, OMOP-CDM 모델을 데이터 모델로 차용

2. 암 임상 라이브러리

  • (정의) 참여 의료기관 EMR(전자의무기록)과 CDW(임상데이터베이스)에 저장된 10개 암 임상 데이터를 암종별로 항목 표준화 * 하여 구축한 암 임상

    데이터셋*( 암 임상학회 검증을 통한 항목 정의서 기반 )

  • (모델) 각 암 종별 스키마는 환자, 진단, 검사, 치료, 추적관찰의 5가지 그룹으로 구성되며, 암 종별 특성에 따라 중분류를 설계

임상 라이브러리 구축단계

질환 전문 학회 지문과 참여병원 간 협의를 통해 임상 데이터 수집을 위한 표준 항목, 정의 및 수집 범위 결정 / 항목 정의
                      	
                      	참여병원 간 동일한 규격의 임상 데이터 수집을 위한 표준 데이터베이스 설계 / 데이터 베이스 설계
                      	
                      	임상 라이브러리 구축 가이드에 따라 데이터 추출 및 적재 / 임상 데이터 추출 및 적재 질환 전문 학회 지문과 참여병원 간 협의를 통해 임상 데이터 수집을 위한 표준 항목, 정의 및 수집 범위 결정 / 항목 정의
                      	
                      	참여병원 간 동일한 규격의 임상 데이터 수집을 위한 표준 데이터베이스 설계 / 데이터 베이스 설계
                      	
                      	임상 라이브러리 구축 가이드에 따라 데이터 추출 및 적재 / 임상 데이터 추출 및 적재

구축 계획 세부 내용

국내 주요 15개 병원 참여로 임상 라이브러리 구축 추진

참여의료 기관
                      	가천대길병원 / 건양대학교병원 / 고려대학교의료원 / 국립암센터 / 대구카톨릭대학교병원 / 부산대학교병원 / 분당서울대학교병원 / 삼성서울병원 / 서울대학교병원 / 서울아산병원 / 세브란스병원 / 아주대학교병원 / 전북대학교병원 / 한림대학교의료원 / 화순전남대학교병원
                      	
                      	[ 임상 라이브러리 데이터 모델 ]
                      	
                      	Baseline DB
                      	Health System Data
                      	장소정보(Location) / 진료과정보(Care_site) / 제공자정보(Provider)
                      	
                      	Health economics Data
                      	의료비(Cost) / 건강보험정보(Payer_Plan_Period)
                      	
                      	Standardized Derived Elements
                      	상태노출(Condition_ERA) / 약품노출정보(Drug_ERA) / 복용량정보(Dose_ERA)
                      	
                      	Metadata
                      	변환소스정보(CDM_Source) / 메타데이터(Metadata)
                      	
                      	Vocabulary
                      	컨셉정보(Concept) / 코드정보(Vocbulary) / 도메인정보(Domain) / 컨셉계층(Concept_class) / 컨셉관계(Concept_Relationship) / 관계정보(Relationship) / 컨셉동의어(Concept_synonym) / 컨셉계층(Concept_ancestor) / 컨셉매핑정보(Souce_to_concept_map) / 약품성분정보(Drog_strenght) / 코호트 정의(Cohort_definition) / 속성정의(Attribute_definition)
                      	
                      	Clinical data
                      	환자정보(Person) / 관찰기간정보(Obdervation Period) / 내원정보(Visit_occurrence) / 내원상세정보(Visit_Detail) / 진단정보(Condition_occurrence) / 약물정보(Drug exposure) / 처치정보(Procedure_occurrence) / 처치재료정보(Device_exposure) / 관찰정보(Observation) / 검사측정(Measurement) / 사망정보(Death) / 의무기록(Note) / 의무기록(Note NLP) / 조직검체(Specimen) / 사실관계정보(Fact relationship)
                      	
                      	원내 중암 암등록
                      	
                      	암 임상 라이브러리
                      	위암(Gastric Cancer) / 유방암(Breast Cancer) / 간암(Liver Cancer) / 대장암(Colorectal Cancer) / 췌장암(Pancreatic Cancer) / 폐암(Lung Cancer) / 전립선암(Prostate Cancer) / 자궁경부암(Cervical Cancer) / 신장암(Renal Cancer) / 혈액암(Hematologic Cancer) 참여의료 기관
                      	가천대길병원 / 건양대학교병원 / 고려대학교의료원 / 국립암센터 / 대구카톨릭대학교병원 / 부산대학교병원 / 분당서울대학교병원 / 삼성서울병원 / 서울대학교병원 / 서울아산병원 / 세브란스병원 / 아주대학교병원 / 전북대학교병원 / 한림대학교의료원 / 화순전남대학교병원
                      	
                      	[ 임상 라이브러리 데이터 모델 ]
                      	
                      	Baseline DB
                      	Health System Data
                      	장소정보(Location) / 진료과정보(Care_site) / 제공자정보(Provider)
                      	
                      	Health economics Data
                      	의료비(Cost) / 건강보험정보(Payer_Plan_Period)
                      	
                      	Standardized Derived Elements
                      	상태노출(Condition_ERA) / 약품노출정보(Drug_ERA) / 복용량정보(Dose_ERA)
                      	
                      	Metadata
                      	변환소스정보(CDM_Source) / 메타데이터(Metadata)
                      	
                      	Vocabulary
                      	컨셉정보(Concept) / 코드정보(Vocbulary) / 도메인정보(Domain) / 컨셉계층(Concept_class) / 컨셉관계(Concept_Relationship) / 관계정보(Relationship) / 컨셉동의어(Concept_synonym) / 컨셉계층(Concept_ancestor) / 컨셉매핑정보(Souce_to_concept_map) / 약품성분정보(Drog_strenght) / 코호트 정의(Cohort_definition) / 속성정의(Attribute_definition)
                      	
                      	Clinical data
                      	환자정보(Person) / 관찰기간정보(Obdervation Period) / 내원정보(Visit_occurrence) / 내원상세정보(Visit_Detail) / 진단정보(Condition_occurrence) / 약물정보(Drug exposure) / 처치정보(Procedure_occurrence) / 처치재료정보(Device_exposure) / 관찰정보(Observation) / 검사측정(Measurement) / 사망정보(Death) / 의무기록(Note) / 의무기록(Note NLP) / 조직검체(Specimen) / 사실관계정보(Fact relationship)
                      	
                      	원내 중암 암등록
                      	
                      	암 임상 라이브러리
                      	위암(Gastric Cancer) / 유방암(Breast Cancer) / 간암(Liver Cancer) / 대장암(Colorectal Cancer) / 췌장암(Pancreatic Cancer) / 폐암(Lung Cancer) / 전립선암(Prostate Cancer) / 자궁경부암(Cervical Cancer) / 신장암(Renal Cancer) / 혈액암(Hematologic Cancer)

암 임상 라이브러리 데이터 수집 계획

2022년 (1차년도) >
                   	Baseline DB
                   	위암 / 유방암
                   	
                   	2023년 (2차년도) >
                   	대장암 / 간암
                   	
                   	2024년 (3차년도) >
                   	췌장암 / 폐암 / 전립선암
                   	
                   	2025년 (4차년도)
                   	자궁경부암 / 신장암 / 혈액암
                   	
                   	※’22년부터 ’25년까지 10개 암 종의 임상 라이브러리 데이터 구축 2022년 (1차년도) >
                   	Baseline DB
                   	위암 / 유방암
                   	
                   	2023년 (2차년도) >
                   	대장암 / 간암
                   	
                   	2024년 (3차년도) >
                   	췌장암 / 폐암 / 전립선암
                   	
                   	2025년 (4차년도)
                   	자궁경부암 / 신장암 / 혈액암
                   	
                   	※’22년부터 ’25년까지 10개 암 종의 임상 라이브러리 데이터 구축

암 임상 라이브러리 데이터 표준화 절차

  • 1. 암 진료 프로세스에 따라 발생하는 다양한 항목도출
암 공통항목
                   	추적시작 / 진단 / 암등록 / 진단
                   	
                   	암 특화항목
                   	수술 / 항암 / 재발 / 치료
                   	
                   	사망 암 공통항목
                   	추적시작 / 진단 / 암등록 / 진단
                   	
                   	암 특화항목
                   	수술 / 항암 / 재발 / 치료
                   	
                   	사망
  • 2. 국내 주요 학회 및 전문가의 논의를 통한 암 특화 항목 도출
1 암 종별 학회 / 암 종별 표준항목 정의
                   	공통, 특화항목 정의
                   	한국보건의료 / 정보원
                   	국립암센터 / 자료 활용 및 협업
                   	표준화 작업
                   	
                   	암 특화학회
                   	
                   	표준항목 정의 프로세스
                   	
                   	+ 암 특화항목 구성항목의 중요도 도출
                   	
                   	암 공통학회
                   	
                   	2 대한종양내과학회 대한 방사선종양학회 / 치료관련항목 검토요청
                   	
                   	표준항목 및 값 도출 / 원천 데이터셋 / 코호트 데이터셋
                   	
                   	암 종별 표준항목 정의 지침서 1 암 종별 학회 / 암 종별 표준항목 정의
                   	공통, 특화항목 정의
                   	한국보건의료 / 정보원
                   	국립암센터 / 자료 활용 및 협업
                   	표준화 작업
                   	
                   	암 특화학회
                   	
                   	표준항목 정의 프로세스
                   	
                   	+ 암 특화항목 구성항목의 중요도 도출
                   	
                   	암 공통학회
                   	
                   	2 대한종양내과학회 대한 방사선종양학회 / 치료관련항목 검토요청
                   	
                   	표준항목 및 값 도출 / 원천 데이터셋 / 코호트 데이터셋
                   	
                   	암 종별 표준항목 정의 지침서
  • 3. K-CURE 참여병원 의료분야 전문가의 논의를 통한 표준항목 확정 및 데이터베이스 설계
전문의
                   	암 임상 라이브러리 표준항목 관리 및 표준용어 매핑 지원
                   	
                   	보건의료 정보관리사
                   	암 임상 라이브러리 표준용어 및 메타데이터 관리
                   	
                   	데이터 전문가
                   	원내 암 임상 라이브러리 구축 및 품질진단 수행 지원
                   	스키마적용 / 집계정보 산출 / 품질진단 수행 / 데이터 프로파일링 수행 전문의
                   	암 임상 라이브러리 표준항목 관리 및 표준용어 매핑 지원
                   	
                   	보건의료 정보관리사
                   	암 임상 라이브러리 표준용어 및 메타데이터 관리
                   	
                   	데이터 전문가
                   	원내 암 임상 라이브러리 구축 및 품질진단 수행 지원
                   	스키마적용 / 집계정보 산출 / 품질진단 수행 / 데이터 프로파일링 수행

암 임상 라이브러리 표준 및 품질관리

  • 표준화 품질관리 분과 운영을 통해 암 임상 라이브러리의 표준 및 품질관리
표준관리
                   	표준항목
                   	암 공통항목 / 암 특화항목
                   	
                   	표준용어
                   	진단
                   	KCD, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	수술, 처치
                   	ICD-9-CM, EDI, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	검사
                   	LOINC(진검), EDI, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	약제
                   	ATC, 주성분코드, EDI, RxNorm, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	방사선
                   	EDI, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	표준스키마
                   	도메인 / 코드
                   	
                   	참여병원 신규 표준 도출 > 표준화 품질관리 분과 표준 등록 요청 > 신규 표준 적용 및 공지
                   	
                   	품질관리
                   	품질관리 지표
                   	임상 라이브러리 구축
                   	일관성 / 유효성 / 정확성 / 안전성 / 보안성 / 유용성 / 준비성 / 접근성 / 적시성
                   	
                   	비정형 데이터 품질관리 지표 기준으로 품질 진단 가능한 품질 관리 대상 판단
                   	
                   	품질관리 대상
                   	1.값 / 2.구조 / 3.표준 / 4.관리체계
                   	
                   	품질관리 대상을 구체적으로 품질진단 하기 위해 품질관리 지표 세분화 표준관리
                   	표준항목
                   	암 공통항목 / 암 특화항목
                   	
                   	표준용어
                   	진단
                   	KCD, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	수술, 처치
                   	ICD-9-CM, EDI, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	검사
                   	LOINC(진검), EDI, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	약제
                   	ATC, 주성분코드, EDI, RxNorm, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	방사선
                   	EDI, KOSTOM, UMLS, SNOMED CT
                   	
                   	표준스키마
                   	도메인 / 코드
                   	
                   	참여병원 신규 표준 도출 > 표준화 품질관리 분과 표준 등록 요청 > 신규 표준 적용 및 공지
                   	
                   	품질관리
                   	품질관리 지표
                   	임상 라이브러리 구축
                   	일관성 / 유효성 / 정확성 / 안전성 / 보안성 / 유용성 / 준비성 / 접근성 / 적시성
                   	
                   	비정형 데이터 품질관리 지표 기준으로 품질 진단 가능한 품질 관리 대상 판단
                   	
                   	품질관리 대상
                   	1.값 / 2.구조 / 3.표준 / 4.관리체계
                   	
                   	품질관리 대상을 구체적으로 품질진단 하기 위해 품질관리 지표 세분화

데이터 개방 방안

  • 외부 전문가를 포함한 데이터제공심의위원회, 반출심사위원회에서 활용 • 가명처리 적정성 검토, IRB 심사 후 의료데이터 안심활용센터에서 제공
표준화된 임상 데이터
                   	참여의료기관 암 임상라이브러리
                   	Baseline DB / 암 임상 라이브러리 / 연계키 DB
                   	
                   	적재
                   	
                   	K-CURE 클라우드
                   	병원별 Private Cloud 내에 암 임상 메타데이터 전송
                   	
                   	제공
                   	
                   	안심 활용센터
                   	연구자의 데이터 신청에 대한 심의 승인 후 안심활용센터를 통해 제공 표준화된 임상 데이터
                   	참여의료기관 암 임상라이브러리
                   	Baseline DB / 암 임상 라이브러리 / 연계키 DB
                   	
                   	적재
                   	
                   	K-CURE 클라우드
                   	병원별 Private Cloud 내에 암 임상 메타데이터 전송
                   	
                   	제공
                   	
                   	안심 활용센터
                   	연구자의 데이터 신청에 대한 심의 승인 후 안심활용센터를 통해 제공